Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms