Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms