Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gse1Q3U3C9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gse1Q3U3C9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms