Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Hvcn1Q3U2S8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Hvcn1Q3U2S8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Hvcn1Q3U2S8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hvcn1Q3U2S8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Hvcn1Q3U2S8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Hvcn1Q3U2S8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Hvcn1Q3U2S8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Hvcn1Q3U2S8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Hvcn1Q3U2S8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Hvcn1Q3U2S8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hvcn1Q3U2S8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms