Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms