Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3TTJ4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms