Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc10Q3TLI0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms