Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd8Q3TA59 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms