Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrriq3Q14DL3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms