Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam171bQ14CH0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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