Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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