Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps8Q0P5W1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps8Q0P5W1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms