Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fmn1Q05860 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fmn1Q05860 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fmn1Q05860 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms