Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk18Q04899 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms