Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox13Q04891 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms