Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox12Q04890 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms