Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox10Q04888 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox10Q04888 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox10Q04888 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox10Q04888 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox10Q04888 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox10Q04888 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms