Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms