Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms