Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aplp1Q03157 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aplp1Q03157 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms