Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms