Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms