Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf2raQ00941 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf2raQ00941 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms