Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms