Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms