Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms