Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp9bP98195 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp9bP98195 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms