Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IhhP97812 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IhhP97812 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IhhP97812 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IhhP97812 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IhhP97812 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IhhP97812 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IhhP97812 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IhhP97812 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IhhP97812 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IhhP97812 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IhhP97812 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IhhP97812 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IhhP97812 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms