Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx3-2P97503 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx3-2P97503 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms