Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pitx2P97474 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms