Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Meis3P97368 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms