Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim43bP86448 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms