Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms