Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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