Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabpb2P81069 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms