Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms