Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb13P70321 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms