Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra8P70278 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms