Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms