Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms