Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms