Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rps28P62858 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rps28P62858 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms