Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpcal1P62748 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms