Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbpl1P62340 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms