Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms