Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm3P62311 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms