Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps11P62281 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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