Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vbp1P61759 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms