Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx1bP61264 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms