Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2iP60898 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms